以前， Stylus という CSS を上書きできる Chrome 拡張機能でダークテーマを適用しようとしていたのですが，タイトルの結論に至りました．
Dark Reader に切り替えて
Stylus ではそれぞれのサイトごとにダークテーマを適用する必要がありました．
しかし Dark Reader ではそれがなく，全てのサイトに適用可能です．
見た目に関しても問題は特にありませんでした．
仮に見た目に問題があったとしても，Alt-Shift-D でオン・オフを切り替えられるので問題無いと思います．
また，サイトごとにオン・オフを設定できるらしいので，見た目に問題がある場合はオフにして Stylus で頑張るなどの運用も考えられます．
Stylus の使いどころ
Stylus の使いどころとしては，非表示にしたい項目の非表示などが考えられます．
Twitter では「おすすめユーザ」とか「トレンド」は表示する必要がないと思っているので，それは Stylus で非表示にするとスッキリします．
(Tweetdeck ならそもそも無いんですがね)
というわけでひとまず Dark Reader を使っていきます!
